首先，通过交警部门进行调解，交警判定三轮车为主责，小轿车为次责，那就按责任比例赔付，发票一样按比例开两张即可。

      由当事人相互向对方赔偿,参照机动车交通事故赔偿的有关规定依法赔偿。如果有购买保险的,由保险公司在限额内赔偿。如果没有，由当事人自行赔偿。

     电动三轮车一般被认定为机动车。机动车与机动车之间发生交通事故的，保险公司应当在机动车第三方责任强制保险责任限额内予以赔偿。超过责任限额的，按照以下方式承担赔偿责任：

   1.对事故负全部责任的，承担100%的赔偿责任；

   2.承担主要责任的，承担70%的赔偿责任；

   3.承担同等责任的，承担50%的赔偿责任；

   4.承担次要责任的，承担30%的赔偿责任；

   5.无责任的，不承担赔偿责任；

   6.双方对交通事故无责任的，按照《民法通则》和《人身伤害赔偿司法解释》的规定确定赔偿责任。

   7.不能认定事故责任的，双方各承担50%的赔偿责任。