1、考试方式不同：自考本科没有入学考试，而函授本科实际上是成人高考本科，只有通过国家统一的成人高考才能入学。

2、学制不同：自考本科没有学制限制，只要所有报考专业的科目都通过考试，就可以申请毕业；函授本科考生在10月考试后，第二年3月左右注册学籍，需要2.5年毕业，在周末或假期集中授课。

3、招生对象不同：除个别省要求报考自考本科出示专科毕业证外，多数省可直接报考自考本科，即未取得专科学历的学生，可同时参加专科和本科考试，只需在本科申请毕业时，提供专科学历即可。

    自考本科是高等教育自学考试，而函授本科是成人高考的一种学习形式。

    自考没有入学考试，考生可以根据自己的情况选择相关的专业，参加专业课程；成人高考是成人高校招生的全国统一考试，是中国成人高校选拔合格的毕业生进入更高层次教育的入学考试。