1、方式不同
自考本科是学历提升方式的一种，专升本是不同学历提升方式的总称，对于考生要求各不相同，可以说深圳自考本科是深圳专升本方式的一种。
2、费用不同
自考本科费用从几百到几千不等，是获得本科费用最低的一种方式，深圳专升本其中费用在最高的是远程和电大专升本，其次是统招专升本和成考专升本。
3、毕业时间不同
自考本科考生考得快毕业就快，而其他专升本方式都有固定学制，考生必须修满学制，在学制内完成所有学习内容。
4、含金量不同
各种方式的含金量依次为：统招专升本>自考本科>成考专升本>远程专升本>电大专升本